Forskare i hybridisering och copy number variation

Lunds universitet grundades 1666 och rankas återkommande som ett av världens främsta lärosäten. Här finns omkring 46 000 studenter och 8 500 medarbetare i Lund, Helsingborg och Malmö. Vi förenas i vår strävan att förstå, förklara och förbättra vår värld och människors villkor. Lunds universitet välkomnar sökande med olika bakgrund och erfarenheter. Jämställdhet, lika villkor och mångfald är grundläggande principer för alla delar av vår verksamhet. Ämnesbeskrivning Vi rekryterar en forskare tidigt i karriären för en karriärsutvecklingsposition inom Runemarklabbet, med arbete i VR-projektet “The role of novel patterns of gene expressoin in hybrid adaptation”. Projektet undersöker genuttryckets roll i hur ny variation och evolutionära anpassningar kan uppstå genom hybridisering. Projektets huvudfråga gäller hur strukturella varianter, i synnerhet copy number variation (CNV) bidrar till detta. Vi samlar för närvarande prover till ett unikt dataset av jästhybrider och deras founder strains under flera stressförhållanden och repeterad meios för att bredda vår insikt inom detta fält. Forskaren kommer att samarbeta nära med kollegor, genomföra analyser av strukturella varianter i föräldraarter och hybrider med fokus på copy number variation och dess effekter på genuttryck, samt syntetisera arbetet för publikation. Forskaren kommer att arbeta nära HybridExpress-teamet bestående av en labmanager, en doktorand och två post docs. Det kommer att finnas möjligheter till mentorskap. Projektet leds av universitetslektor Anna Runemark vars labb är en del av SPeciation, Adaptation and Co-Evolution gruppen inom divisionen biologisk mångfald och evolution. Arbetsuppgifter De huvudsakliga uppgifterna i en forskartjänst är att bedriva forskning. Detaljerad beskrivning av arbetsuppgifterna: Bioinformatisk analys av CNV och genomiska prediktorer för CNVs, inklusive transposabla element och metylering Analys av CNV-variation i hybrider och föräldraarter med fokus på deras effekter på genuttryck Tolkning av bioinformatiska resultat, figurberedning Syntetisera data för publicering Kandidaten kan potentiellt bidra till undervisningen på bioinformatikprogrammet. Krav för anställningen För anställning till denna karriärutvecklingstjänst krävs att den sökande har en doktorsexamen, eller en internationell examen som bedöms likvärdig med en doktorsexamen, inom evolutionär genomik. Även om det inte finns några formella krav på karriärålder, syftar tjänsten till karriärutveckling för en forskarkarriär och meriter kommer att beaktas i ljuset av karriäråldern. Övriga krav är: Starka erfarenheter av bioinformatik, inklusive analys av hybridgenom. Expertis i att detektera och analysera copynumber variation och att undersöka dess funktionella och evolutionära signifikans.  Erfarenhet av att utveckla statisktiska metoder och bioinformatiska verktyg för analys av genomisk data.  Färdighet i att analysera stora genomiska och transkriptomi dataset med R, Perl och Unix. Erfarenhet av att självständigt driva ett mikrobiskt laboratorium under kortare tid. Meriterande för anställningen Detta är en position menad för karriärsutveckling för en framtida akademisk karriär med forskningsfokus. Positionen är tänkt som ett tidigt steg i en karriär och utvärdering av sökande kommer primärt baseras på deras forskningskvalifikationer och potential som forskare. Särskild tyngd kommer läggas på färdigheter inom forskningsämnet i.e., hybridiseringsgenomik i synnerhet analys av strukturella varianter i form av copy number variants. God förmåga att utveckla och genomföra forskning av hög kvalitet, vilket bedöms av publikationshistorik med starka självständiga bidrag och publikationer av hög kvalitet; samt demonstrerad förmåga att kommunicera forskningsresultat på internationella konferenser. Ett starkt track-record av att utveckla egen forskning, vilket bedöms av uppvisande av högt meriterade anslagsansökningar. Starka erfarenheter av bioinformatik, inklusive analys av metylering och hi